Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP3Q9H6T3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms