Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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