Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00597Q9H2U6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00597Q9H2U6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms