Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNMDQ9H2S6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms