Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCOLN1Q9GZU1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCOLN1Q9GZU1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms