Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms