Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIPCQ9C0C6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms