Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA4CQ9C0C4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms