Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPF3BQ9BZI7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms