Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BCO2Q9BYV7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCO2Q9BYV7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms