Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNG6Q9BXT2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms