Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC106Q9BWC9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms