Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SHANK2-AS3Q9BTD1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms