Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms