Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms