Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CICQ96RK0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms