Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPQ96QV1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHIPQ96QV1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms