Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHF12Q96QT6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms