Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNGAP1Q96PV0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms