Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP4Q96PP9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP4Q96PP9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms