Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX11Q96FC9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX11Q96FC9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms