Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms