Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1AQ96AJ9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms