Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKL1Q969V6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms