Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF25Q93038 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms