Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRG4Q92954 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRG4Q92954 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms