Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMPDL3BQ92485 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms