Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms