Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC4Q8WW27 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms