Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms