Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6DQ8NFY4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms