Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD1Q8NA66 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms