Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71DQ8N9W8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms