Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms