Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC71Q8N4P6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC71Q8N4P6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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