Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLIP4Q8N3C7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLIP4Q8N3C7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLIP4Q8N3C7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLIP4Q8N3C7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLIP4Q8N3C7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CLIP4Q8N3C7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CLIP4Q8N3C7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CLIP4Q8N3C7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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