Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLASRPQ8N2M8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLASRPQ8N2M8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms