Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms