Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC83Q8IWF9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms