Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms