Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP9Q7RTR0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRP9Q7RTR0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms