Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAXIP1Q6ZW49 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms