Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms