Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIG3Q6UXM1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms