Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCD3Q6STE5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms