Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms