Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms