Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRCH2Q5VUJ6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms