Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAD1Q5T700 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAD1Q5T700 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms