Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms